Виявлення вірусів комплексу борознистості деревини на виноградних насадженнях Одеської області

Н. Ніколаєва
Анотація

Віруси винограду наносять великої шкоди виноградним насадженням півдня України, особливого значення мають віруси комплексу борознистості деревини (Rugose wood complex (англ.) – RWC). Метою досліджень було виявлення наявності симптомів вірусів цього комплексу на виноградних насадженнях в Одеській області і їх ідентифікація. Методи. Для проведення цих досліджень використовували фітосанітарне обстеження на наявність симптомів вірусів комплексу борознистості деревини, для ідентифікації вірусів застосовували метод полімеразної ланцюгової реакції зі зворотною транскрипцією у режимі реального часу (ЗТ-РЧ-ПЛР). Результати. В результаті фітосанітарного обстеження виноградних насаджень Болградського, Ізміїльського і Овідіопольського районів Одеської області було виявлено симптоми вірусного ураження виноградних рослин. Вперше було ідентифіковано віруси винограду модифікованим методом ЗТ-РЧ-ПЛР, підібрані умови проведення діагностики. Висновки і перспективи. В результаті фітосанітарного обстеження виявлено віруси винограду, що належать до комплексу борознистості. Виявлено і ідентифіковано ураження виноградних кущів вірусами комплексу борознистості деревини на виноградних насадженнях Болградського району Одеської області. Під час проведення діагностики було оптимізовано параметри ПЛР, а саме, відпрацьовано температуру відпалу та концентрацію магнію. Одержані дані дозволять своєчасно виявити віруси комплексу борознистості винограду, які можуть призвести до значного зниження врожаю і запобігти їх розповсюдження

Ключові слова

ЗТ-РЧ-ПЛР, виноград, вірус А винограду (GVА), вірус В винограду (GVВ), борознистість деревини Рупестріс (RSPaV), Ямчатість деревини ЛН 33 (LN 33 stem grooving)

ЦИТУВАТИ
Nikolaeva, N. (2022). Detection of viruses of the rugose wood complex on vineyards of the Odessa region. Scientific Reports of the National University of Life and Environmental Sciences of Ukraine, 18(3). https://doi.org/dopovidi2022.03.001
Використані джерела
  1. Walter, B., & Martelli, G.P. (1998). Considerations on grapevine selection and certification. Vitis, 37(2), 87-90.
  2. Bertin, S., Mannini, F., Bosco, D., Gambino, G., Cuozzo, D., & Gribaudo, I. (2009). Spread of GVA, GLRaV-1 and -3 and role of the mealybug vector Heliococcus bohemicus in a vineyard of Langhe (Northwestern Italy). Extended abstracts of the 16th Meeting of ICVG, Dijon Le Progrès Agricole et Viticole, Hors Série. Spécial Congrés ICVG, 279-280.
  3. Martelli, G.P., Adams, M.J., Kreuze, J.F., & Dolja, V.V. (2007). Family Flexiviridae: A case study in virion and genome plasticity. Annual Review of Phytopathology, 45, 73-100.
  4. Constable, F., & Rodoni, B. (2011). Rugose wood – associated viruses. Department of Primary Industries (DPI) Wine Australia for Australian Wine, 1-5.
  5. Krayev, V.G. (2001). Modern classification and nomenclature of plant viruses. Microbiological Journal, 63(2), 20-66.
  6. Minafra, A. (2000). Rugose wood of grapevines. XIIIth ICVG Meeting: Abstracts. Adelaide, Australia, 12-17 March 2000, 30-34.
  7. Meng, B.Z., Johnson, R., Peressini, S., Forsline, P.L., & Gonsalves, D. (1999). Rupestris stem pitting-associated virus-1 is consistently detected in grapevines that are infected with rupestris stem pitting. European Journal of Plant Pathology, 105, 191-199.
  8. European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO). (2013). Molecular biomarker analysis – General definitions and requirements for microarray detection of specific nucleic acid sequences. ISO 16578. Retrieved from http://www.eppo.org.
  9. Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C., & Tamura, K. (2018). MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution, 35, 1547-1549.
  10. Milkus, B.N., Konup, L.O., Zhunko, I.D., & Limanska, N.V. (2005). Testing of some grape varieties for the presence of crown gall and short-knot viruses and leaf curl. Microbiological Journal, 67(1), 41-48.
  11. Rowhani, A. (2000). Simplified sample preparation method and one-tube RTPCR for grapevine viruses. Proceedings of XIII International Council for the Study of Viruses and Virus-Like Diseases of the Grapevine, 82.
  12. Osmana, F., Leutenegger, C., Golino, D., & Rowhani, A. (2008). Comparison of low-density arrays, RTPCR and real-time TaqMan® RT-PCR in detection of grapevine viruses. Journal of Virological Methods, 149, 292-299.
  13. Roy, A., Fayad, A., Barthe, G., & Brlansky, R.H. (2005). A multiplex polymerase chain reaction method for reliable, sensitive and simultaneous detection of multiple viruses in citrus trees. Journal of Virological Methods, 129, 47-55.