Оцінка генотипів пшениці м'якої озимої за даними дистанційного зондування та агрономічними ознаками, пов’язаними з урожайністю

Р. Топко, С. Волощук, Ганна Ковалишина
Анотація

Генетичне поліпшення пшениці потребує вдосконалення та застосування більш ефективних методів фенотипування та оцінки генетичної переваги селекційних ліній. Мета. Оцінити можливість використання спектральних вегетаційних індексів з включенням визначених генотипових цінностей, порівняти генетичний приріст урожайності зерна та інших ознак, відібрати кращі генотипи пшениці з використанням багатоознакового індексу та багатовимірних статистичних методів. Методи: польовий, визначення вегетаційних індексів за допомогою БПЛА, методи множинної регресії, AMMI, GGE-біплот та REML/BLUP. Селекційні індекси розраховували за сукупністю ознак. Результати. 12 сортів і ліній пшениці м’якої озимої оцінено за врожайністю зерна, індексом NDVI та іншими ознаками. З використаням GGE-біплоту та AMMI аналізу проведено комплексну оцінку генотипів за продуктивністю та стабільністю. За допомогою REML/BLUP-аналізу визначено генетичні параметри та генотипові значення для ряду досліджених ознак. На основі отриманих даних розраховано селекційні індекси за сукупністю ознак. Встановлено можливість використання спектральних вегетаційних індексів, отриманих з БПЛА, у селекційному процесі. Більш точна ідентифікація генотипів за комплексом ознак забезпечується поєднаним застосуванням багатовимірних статистичних методів, селекційних індексів і показників NDVI. Метод REML/BLUP у поєднанні з багатовимірними методами AMMI та GGE-біплот з графічним виділенням генотипів за індексом Z дозволяє визначити перспективні за комплексом ознак. Виділено лінії ЛЮТ 55198, ЛЮТ 37519, ЛЮТ 60049, ЛЮТ 6010 і сорти МІП Лада, МІП Дніпрянка для подальшого використання в програмах селекції. Перспективою подальших досліджень є підвищення точності оцінки і добору потенційно високоврожайних і стабільних ліній пшениці за допомогою дистанційного

Ключові слова

Triticum aestivum L., генотип, індекс NDVI, GGE-біплот, аналіз REML/BLUP, генетичний приріст, селекційний індекс

ЦИТУВАТИ
Topko, R., Voloshchyk, S., & Kovalyshyna, H. (2023). Evaluation of winter bread wheat genotypes based on remote sensing data and agronomic traits related to yield. Scientific Reports of the National University of Life and Environmental Sciences of Ukraine, 19(5). https://doi.org/10.31548/dopovidi5(105).2023.012
Використані джерела

[1] Ray, D.K., Mueller, N.D., West, P.C., & Foley, J.A. (2013). Yield trends are insufficient to double global crop production by 2050. PLoS ONE, 8(6), article number e66428. doi: 10.1371/journal.pone.0066428.

[2] Chawade, A., Van Ham, J., Blomquist, H., Bagge, O., Alexandersson, E., & Ortiz, R. (2019). High-throughput field-phenotyping tools for plant breeding and precision agriculture. Agronomy, 10(5), article number 258. doi: 10.3390/agronomy9050258.

[3] Bendig, J., Yu, K., Aasen, H., Bolten, A., Bennertz, S., Broscheit, J., Gnyp, M.L., & Bareth, G. (2015). Combining UAV-based plant height from crop surface models, visible, and near infrared vegetation indices for biomass monitoring in barley. International Journal Of Applied Earth Observation And Geoinformation, 39, 79-87. doi: 10.1016/j.jag.2015.02.012.

[4] Chapman, S.C., Merz, T., Chan, A., Jackway, P., Hrabar, S., Dreccer, M.F., Holland, E., Zheng, B., Ling, T.J., & Jimenez-Berni, J. (2014). Pheno-copter: A low-altitude, autonomous remote-sensing robotic helicopter for high-throughput field-based phenotyping. Agronomy, 4(2), 279-301. doi: 10.3390/agronomy4020279.

[5] Haghighattalab, A., González Pérez, L., Mondal, S., Singh, D., Schinstock, D., Rutkoski, J., Ortiz-Monasterio, I., Singh, R.P., Goodin, D., & Poland, J. (2016). Application of unmanned aerial systems for high throughput phenotyping of large wheat breeding nurseries. Plant Methods, 12(1), article number 35. doi: 10.1186/s13007-016-0134-6.

[6] Zhang, J., Virk, S., Porter, W., Kenworthy, K., Sullivan, D., & Schwartz, B. (2019). Applications of unmanned aerial vehicle based imagery in turfgrass field trials. Frontiers In Plant Science, 10, article number 279. doi: 10.3389/fpls.2019.00279.

[7] Lee, C.-J., Yang, M.-D., Tseng, H.-H., Hsu, Y.-C., Sung, Y., & Chen, W.-L. (2023). Single-plant broccoli growth monitoring using deep learning with UAV imagery. Computers And Electronics In Agriculture, 207, article number 107739. doi: 10.1016/j.compag.2023.107739.

[8] Potgieter, A.B., George-Jaeggli, B., Chapman, S.C., Laws, K., Cadavid, L.A.S., Wixted, J., Watson, J., Eldridge, M., Jordan, D.R., & Hammer, G.L. (2017). Multi-spectral imaging from an unmanned aerial vehicle enables the assessment of seasonal leaf area dynamics of sorghum breeding lines. Frontiers In Plant Science, 8, article number 1532. doi: 10.3389/fpls.2017.01532.

[9] Guillen-Climent, M.L., Zarco-Tejada, P.J., Berni, J.A.J., North, P.R.J., & Villalobos, F.J. (2012). Mapping radiation interception in row-structured orchards using 3D simulation and high-resolution airborne imagery acquired from a UAV. Precision Agriculture, 13(4), 473-500. doi: 10.1007/s11119-012-9263-8.

[10] Cabrera-Bosquet, L., Molero, G., Stellacci, A., Bort, J., Nogués, S., & Araus, J. (2011). NDVI as a potential tool for predicting biomass, plant nitrogen content and growth in wheat genotypes subjected to different water and nitrogen conditions. Cereal Research Communications, 39(1), 147-159. doi: 10.1556/CRC.39.2011.1.15.

[11] Acorsi, M.G., Abati Miranda, F.D.D., Martello, M., Smaniotto, D.A., & Sartor, L.R. (2019). Estimating biomass of black oat using UAV-based RGB imaging. Agronomy, 9(7), article number 344. doi: 10.3390/agronomy9070344

[12] Hassan, M.A., Yang, M., Rasheed, A., Yang, G., Reynolds, M., Xia, X., Xiao, Y., & He, Z. (2019). A rapid monitoring of NDVI across the wheat growth cycle for grain yield prediction using a multi-spectral UAV platform. Plant Science, 282, 95-103. doi: 10.1016/j.plantsci.2018.10.022

[13] Su, J., Liu, C., Coombes, M., Hu, X., Wang, C., Xu, X., Li, Q., Guo, L., & Chen, W.H. (2018). Wheat yellow rust monitoring by learning from multispectral UAV aerial imagery. Computers And Electronics In Agriculture, 155, 157-166. doi: 10.1016/j.compag.2018.10.017

[14] Rutkoski, J., Poland, J., Mondal, S., Autrique, E., Pérez, L.G., Crossa, J., Reynolds, M., & Singh, R. (2016). Canopy temperature and vegetation indices from high-throughput phenotyping improve accuracy of pedigree and genomic selection for grain yield in wheat. G3: Genes, Genomes, Genetics, 6(9), 2799-2808. doi: 10.1534/g3.116.032888

[15] Hoffmeister, D., Waldhoff, G., Korres, W., Curdt, C., & Bareth, G. (2016). Crop height variability detection in a single field by multi-temporal terrestrial laser scanning. Precision Agriculture, 17, 296-312. doi: 10.1007/s11119-015-9420-y

[16] Du, M., & Noguchi, N. (2017). Monitoring of wheat growth status and mapping of wheat yield’s within-field spatial variations using color images acquired from UAV-camera system. Remote Sensing, 9(3), article number 289. doi: 10.3390/rs9030289

[17] Olanrewaju, S., Rajan, N., Ibrahim, A.M.H., Rudd, J.C., Liu, S., Sui, R., Jessup, K.E., & Xue, Q. (2019). Using aerial imagery and digital photography to monitor growth and yield in winter wheat. International Journal Of Remote Sensing, 40(18), 6905-6929. doi: 10.1080/01431161.2019.1597303

[18] Yang, C., & Everitt, J.H. (2002). Relationships between yield monitor data and airborne multidate multispectral digital imagery for grain sorghum. Precision Agriculture, 3, 373-388. doi: 10.1023/A:1021544906167

[19] Duan, B., Fang, S., Zhu, R., Wu, X., Wang, S., Gong, Y., & Peng, Y. (2019). Remote estimation of rice yield with unmanned aerial vehicle (UAV) data and spectral mixture analysis. Frontiers In Plant Science, 10, article number 204. doi: 10.3389/fpls.2019.00204

[20] Wang, F., Wang, F., Zhang, Y., Hu, J., Huang, J., & Xie, J. (2019). Rice yield estimation using parcel-level relative spectral variables from UAV-based hyperspectral imagery. Frontiers In Plant Science, 10, article number 453. doi: 10.3389/fpls.2019.00453.

[21] Sun, J., Poland, J.A., Mondal, S., Crossa, J., Juliana, P., Singh, R.P., Rutkoski, J.E., Jannink, J.L., Crespo-Herrera, L., Velu, G., Huerta-Espino, J., & Sorrells, M.E. (2019). High-throughput phenotyping platforms enhance genomic selection for wheat grain yield across populations and cycles in early stage. Theoretical And Applied Genetics, 132(6), 1705-1720. doi: 10.1007/s00122-019-03309-0.

[22] Dospekhov, B.A. (1985). Methodology of field experiments (with the basics of statistical processing of research results). Moscow: Agropromizdat.

[23] Volkodav, V. (Ed.). (2003). Methods of examination and state variety testing grains, cereals and legumes. right protection for plant varieties. Kyiv: Alefa.

[24] Rouse, J.W., Haas, R.H., Schell, J.A., Deering, D.W., & Harlan, J.C. (1973). Monitoring vegetation systems in the great plains with ERTS. Third Earth Resources Technology Satellite (ERTS) Symposium, 1, 309-317.

[25] Zobel, R.W., Wright, M.J., & Gauch, H.G. (1988). Statistical analysis of a yield trial. Agronomy Journal, 80(3), 388-393.

[26] Gauch, H.G. (2013). A simple protocol for AMMI analysis of yield trials. Crop Science, 53(5), 1860-1869. doi: 10.2135/cropsci2013.04.0241.

[27] Yan, W., Hunt, L.A., Sheng, Q., & Szlavnics, Z. (2000). Cultivar evaluation and mega-environment investigation based on the GGE biplot. Crop Science, 40(3), 597-605.

[28] Pacheco, A., Vargas, M., Alvarado, G., Rodríguez, F., López, M., Crossa, J., & Burgueño, J. (2016). GEA-R (Genotype x Environment Analysis with R for Windows.) Version 4.1. Retrieved from http://hdl.handle.net/11529/10203

[29] Alvarado, G., López, M., Vargas, M., Pacheco, A., Pacheco, A., Burgueño, J., & Crossa, J. (2016). META-R (Multi Environment Trial Analysis with R for Windows.) Version 6.0. Retrieved from http://hdl.handle.net/11529/10201

[30] Mulamba, N.N., & Mock, J.J. (1978). Improvement of yield potential of the Eto Blanco maize (Zea mays L.) population by breeding for plant traits. Egyptian Journal Of Genetics And Cytology, 7, 40-51.

[31] Wricke, G., & Weber, W.E. (1986). Quantitative Genetics And Selection In Plant Breeding (1st ed.). New York: Walter de Gruyter.